Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GBP4Q96PP9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms