Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NLRP3Q96P20 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NLRP3Q96P20 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms