Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LRRC7Q96NW7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC7Q96NW7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms