Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH12Q96NR8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms