Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1Q96NA8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1Q96NA8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms