Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DCHS1Q96JQ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms