Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms