Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC97Q96F63 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCDC97Q96F63 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms