Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNFT2Q96EX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms