Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MALSU1Q96EH3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms