Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSUN4Q96CB9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms