Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIFAP3Q92845 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIFAP3Q92845 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms