Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
UBXN4Q92575 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UBXN4Q92575 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms