Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SSMEM1Q8WWF3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SSMEM1Q8WWF3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms