Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C15orf40Q8WUR7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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