Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC12Q8WUD4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC12Q8WUD4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms