Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
U2AF1L4Q8WU68 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
U2AF1L4Q8WU68 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms