Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DDX54Q8TDD1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDX54Q8TDD1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms