Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KLHDC9Q8NEP7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHDC9Q8NEP7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms