Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNNM3Q8NE01 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNNM3Q8NE01 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms