Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPFIBP2Q8ND30 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPFIBP2Q8ND30 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms