Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU4

CCDC191, Coiled-coil domain-containing protein 191, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC191Q8NCU4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC191Q8NCU4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC191Q8NCU4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms