Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PDCL2Q8N4E4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms