Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00518Q8N0U6 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms