Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LMNTD2Q8IXW0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LMNTD2Q8IXW0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms