Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HAPLN4Q86UW8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HAPLN4Q86UW8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms