Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NPM2Q86SE8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NPM2Q86SE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms