Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT28Q7Z3Y7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT28Q7Z3Y7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms