Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SETXQ7Z333 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms