Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TMUB2Q71RG4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms