Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
USP43Q70EL4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
USP43Q70EL4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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