Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS12Q6ZW61 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS12Q6ZW61 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms