Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf139Q6ZV77 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms