Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPOCD1Q6ZMY3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPOCD1Q6ZMY3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms