Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SUSD1Q6UWL2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SUSD1Q6UWL2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms