Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
KLHL35Q6PF15 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms