Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EDC4Q6P2E9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EDC4Q6P2E9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EDC4Q6P2E9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms