Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SWSAP1Q6NVH7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SWSAP1Q6NVH7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms