Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHX8Q68G74 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms