Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INTS3Q68E01 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INTS3Q68E01 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms