Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECM29Q5VYK3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms