Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SUSD4Q5VX71 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SUSD4Q5VX71 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms