Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC30Q5VVM6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms