Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC181Q5TID7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC181Q5TID7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms