Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LGSNQ5TDP6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LGSNQ5TDP6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms