Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NHSL1Q5SYE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NHSL1Q5SYE7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NHSL1Q5SYE7 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms