Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SPANXN3Q5MJ09 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPANXN3Q5MJ09 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SPANXN3Q5MJ09 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SPANXN3Q5MJ09 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms