Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C4orf17Q53FE4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C4orf17Q53FE4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms