Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CEP55Q53EZ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP55Q53EZ4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms