Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SBK1Q52WX2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms